Juliana, Tjeuw (2001) PCR DAN RT-PCR GENOM JATI (Tectona grandis L.f.) MENGGUNAKAN PRIMER YANG DIRANCANG DARI GEN FLO Antirrhinum, ALF-Petunia, NFL 2-Nicotiana DAN GEN HOMOLOG LEAFYIFLORICA ULA JATI.
Full text not available from this repository.Abstract
Gen LEAFY (LFY) Arabidopsis maupun gen homolog LFY pada tumbuhan lain merupakan salah satu gen yang berperan pada inisiasi pembungaan.Penelitian sebelumnya telah berhasil mengisolasi dan mengkarakterisasi bagian hilir cDNA gen homolog LFY/FLO Jati. Hal ini mendorong dilakukannya penelitian ini yang bertujuan untuk mengisolasi dan mengkarakterisasi bagian hulu gen homolog LFY/FLO pada Jati (Tectona grandis L.f.) dengan pendekatan PCR dan RT-PCR. Metoda yang digunakan adalah isolasi DNA din RNA kuncup bunga Jati, perancangan primer yang terdiri dari sepasang primer yang tidak didegenerasi dengan primer (FLY-1)"forward" dari bagian hulu gen FLO-Antirrhinum dan primer (FLY-1) "reverse" dari bagian hilir gen homolog LFY/FLO pada Jati serta perancangan sepasang primer FLY-2 "forward" dan FLY-2"reverse" yang didegenerasi dari sikuen asam amino gen FLO (Antirrhinum), ALF (Petunia), NFL 2 (Nicotiana). Primer-primer tersebut kemudian digunakan untuk amplifikasi PCR-DNA dan cDNA model-I dan II . Rantai pertama cDNA model-I terdiri dari cDNA-1 yang disintesis dari RNA dengan menggunakan "reverse trancriptase" dan primer FLY-1R serta cDNA-2 yang disintesis dari RNA dengan menggunakan "reverse transcriptase" dan FLY-2R, sedangkan rantai pertama cDNA-II disintesis dari RNA yang menggunakan "reverse transcriptase" dan adapter primer (oligo T).Amplifikasi DNA dan cDNA model I berhasil dilakukan dengan kombinasi primer FLY-1F, FLY-1R dan FLY-2F, dan diperoleh sikuen dengan panjang sekitar 800 pb dan 1200 pb. Amplifikasi cDNA model-II yang dilakukan dengan UAP (primer amplifikasi universal) dan FLY-2F dan berhasil diperoleh sikuen dengan ukuran sekitar 900 pb.Seluruh amplikon tersebut kemudian dikloning dan disikuensing. Hasil sikuen tersebut bila dibandingkan dengan "database" pada "GenBank" menunjukkan kesamaan dengan gen-gen lain pada tumbuhan dan bukan dengan bagian hulu dari gen LFY - Arabidopsis maupun gen homolog LFY pada tanaman lainnya. Analisis lebih lanjut "open reading frame" sikuen DNA dan cDNA model I ukuran 800 pb dan sikuen spesifik pada perbatasan ekson dan intron menunjukkan adanya satu ekson dengan 2 "open reading frame" yang diapit oleh 2 intron dan pada sikuen cDNA model II ditemukan potongan sikuen ekson dan segmen 3' mRNA yang tidak ditranslasi.
| Item Type: | Article |
|---|---|
| Subjects: | Collections > Koleksi Perpustakaan Di Indonesia > Perpustakaan Di Indonesia > JBPTITBPP > S2-Theses > Natural Sciences > Biology > 2001 |
| Divisions: | Universitas Komputer Indonesia > Perpustakaan UNIKOM |
| Depositing User: | Admin Repository |
| Date Deposited: | 16 Nov 2016 07:38 |
| Last Modified: | 16 Nov 2016 07:38 |
| URI: | http://repository.unikom.ac.id/id/eprint/3725 |
Actions (login required)
 |
View Item |
